mislo

Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko · Univerza v Mariboru

Bioinformatika in multi-omske raziskave

Za predmet Bioinformatika in multi-omske raziskave še ni zapiskov.

Imaš svoje zapiske? Objavi jih: ceno določiš ti, z naročnino ti ostane cela, DDV se doda kupcu.

Objavi zapiske

Čakaš na zapiske? Prijavi se in povej. Ko jih kdo objavi, dobiš sporočilo.

Želim zapiske

Kaj lahko narediš že danes

Naloži svoje gradivo za predmet Bioinformatika in multi-omske raziskave: Mai ga prebere in ti iz njega naredi kartice, kviz in razlago, ko ti kaj ni jasno. Če zapiske kasneje objaviš, jih prodajaš tukaj.

Naloži svoje gradivo

Učni načrt

Podatki so iz učnega načrta, ki ga objavlja Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko. Prebrano 6. 9. 2026. Poglej izvirnik

6 kreditnih točk

Obveznosti v urah

  • Predavanja25 ur
  • Vaje30 ur
  • Samostojno delo120 ur
  • Seminarji5 ur

Vsebina

  1. Sistemski pristopi k raziskavam človeškega genoma za personalizirano medicino
  2. Razvoj biobank
  3. Uporaba multi-omskih tehnologij (sekvenciranje celotnega genoma,eksoma in RNAz, masna spektrometrija) za analizo biomolekula (DNA, RNA, proteinov, metabolitov, epigenoma), za odkrivanje molekularnih biooznačevalcev
  4. Uporaba funkcionalnih celičnih modelov za validacijo biooznačevalcev in razlago molekularnih mehanizmov bolezni in odziva na zdravila;
  5. Tehnologija organ na čipu
  6. Tipi kliničnih študij: opazovalne, intervencijske
  7. Odkrivanje in mapiranje bolezenskih genov (izbor bolnikov in družin; pozicijsko kloniranje in definicija kandidatnega področja,; Analiza genetske vezave: izbira mikrosatelitnih označevalcev, rekombinacijska frakcija, vrednost LOD, dvotočkovno mapiranje, večtočkovno mapiranje, programska orodja (GENEHUNTER); asociacijske študije primeri/kontrole; analiza parov sorodnikov; genetske študije iz genomske sekvence: definicija lokusa; identifikacija in eksrakcija genomske sekvence med dvema markerjema; preverjanje integritete genomske sekvence med dvema markerjema; definicija znanih in novih genov na sekvenci kandidatnega področja genoma; izbira kandidatnih genov za analizo-povezovanje z biološko in fiziološko funkcijo, ekspresijo genov; identifikacija novih markerjev v kandidatnem področju genoma; načrtovanje panela genetskih markerjev za gensko tipizacijo)
  8. Identifikacija polimorfizmov enega nukleotida (SNP) in načrtovanje protokola genske tipizacije: identifikacija SNPjev; določitev funkcijskih in biološko pomembnih SNPjev, načrtovanje začetnih oligonukleotidov za reakcijo PCR; validacija rezutatov genske tipizacije;
  9. Statistična analiza genotipov in alelov pri bolnikih in kontrolah (Hi2, Fischerjev test)
  10. določitev strukture haplotipov (algoritem maksimizacije pričakovanega); genetsko neravnotežje (linkage disequilibrium);
  11. mapiranje kvantitativnih lokusov (QTL)
  12. Pregled metod odkrivanja mutacij in genske tipizacije polimorfizmov
  13. Primeri uspešnega mapiranja bolezenskih genov za monogenske in kompleksne bolezni
  14. Načrtovanje, izvajanje in interpretacija genetskih testov; genetsko svetovanje
  15. Molekularne tarče za načrtovanje bioloških zdravil

Ocenjevanje

Pisni izpit 60 %, Ustni izpit 40 %

Pogoji za vključitev

Poznavanje osnov molekularne biologije, biokemije, humane genetike in bioinformatike

Literatura

  • 1. Dandekar T, Kunz M. Bioinformatics.; Springer-Verlag GmbH Germany, part of Springer Nature 2023
  • 2. BEST, M. C. (urednik), HARTMAN, T. E. (eds.). Metabolomics : recent advances and future applications. Cham: Springer, cop. 2023. ISBN 978-3-031-39093-7

Kako deluje

  1. Zapiske kupiš enkrat in ostanejo tvoji.
  2. V aplikaciji iz njih dobiš kartice, kvize in Mai, ki pozna gradivo.
  3. Ceno določi avtor. Prodajalec je Mislo AI, račun dobiš od nas.