mislo

Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko · Univerza v Mariboru

Uporaba bioinformatike v genomiki

Za Uporabo bioinformatike v genomiki še ni zapiskov.

Imaš svoje zapiske? Objavi jih: ceno določiš ti, z naročnino ti ostane cela, DDV se doda kupcu.

Objavi zapiske

Čakaš na zapiske? Prijavi se in povej. Ko jih kdo objavi, dobiš sporočilo.

Želim zapiske

Kaj lahko narediš že danes

Naloži svoje gradivo za Uporabo bioinformatike v genomiki: Mai ga prebere in ti iz njega naredi kartice, kviz in razlago, ko ti kaj ni jasno. Če zapiske kasneje objaviš, jih prodajaš tukaj.

Naloži svoje gradivo

Učni načrt

Podatki so iz učnega načrta, ki ga objavlja Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko. Prebrano 6. 9. 2026. Poglej izvirnik

9 kreditnih točk

Obveznosti v urah

  • Predavanja30 ur
  • Vaje30 ur
  • Samostojno delo195 ur
  • Seminarji15 ur

Vsebina

  1. Podatkovne zbirke v molekularni biologiji in genomiki (indeksiranje in iskalni profili,; Bibliografske podatkovne zbirke (PubMed),; tekstovne podatkovne zbirke (OMIM),; faktografske podatkovne zbirke ( DNA sekvence (Genbank), genomov, proteinske sekvence (SwissProt), proteinske structure, ekspresijke, metabolne poti,; Integrirani sistemi za dostop do podatkovnih zbirk: Entrez (NCBI), ExPASy , Ensembl)
  2. Sekvenčne poravnave in konsktrukcija filogenetskih dreves: merila sekvenčne podobnosti, poravnava dveh zaporedij, poravnava večih zaporedij, iskanje podobnih zaporedij v podatkovnih zbirkah (skriti modeli Markov, PSI-Blast, profile), filogenetska drevesa (metoda klastrov, klad, problem različnih stopenj evolucije).
  3. Proteinske strukture in odkrivanje novih zdravil: zvijanje in stabilnost proteinske strukture, superpozicija struktur in strukturne poravnave, klasifikacija proteinskih struktur, predikcija strukture in modeliranje, povezava proteinske strukture z genomom, predikcija funkcije proteinov (ortologi, paralogi), računalniško načrtovanje novih zdravil.
  4. Analiza bioloških poti z uporabo orodja Genske ontologije (GO)
  5. Laboratorijske vaje (Populacijska genetika – spoznavanje Hardy-Weinbergovega ravnotežja; Forenzika – metoda AmpliFLP (polimorfizem dolžin pomnoženih fragmentov); Verižna reakcija s polimerazo (PCR); Poliakrilamidna elektroforeza)

Ocenjevanje

Pisni izpit 60 %, Ustni izpit 40 %

Pogoji za vključitev

Poznavanje osnov molekularne biologije, biokemije in molekularne genetike

Literatura

  • 1. Lesk A: Introduction to Bioinformatics. 5th Ed, 2019 Oxford University Press, Oxford, UK
  • 2. Baxevanis AD, Francis Ouellette BF: Bioinformatics A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. 4th Ed, 2020, Wiley-Interscience, A John Wiley & Sons Inc., Publication, New York, USA.

Kako deluje

  1. Zapiske kupiš enkrat in ostanejo tvoji.
  2. V aplikaciji iz njih dobiš kartice, kvize in Mai, ki pozna gradivo.
  3. Ceno določi avtor. Prodajalec je Mislo AI, račun dobiš od nas.