mislo

Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko · Univerza v Mariboru

Transkriptomika

Za Transkriptomiko še ni zapiskov.

Imaš svoje zapiske? Objavi jih: ceno določiš ti, z naročnino ti ostane cela, DDV se doda kupcu.

Objavi zapiske

Čakaš na zapiske? Prijavi se in povej. Ko jih kdo objavi, dobiš sporočilo.

Želim zapiske

Kaj lahko narediš že danes

Naloži svoje gradivo za Transkriptomiko: Mai ga prebere in ti iz njega naredi kartice, kviz in razlago, ko ti kaj ni jasno. Če zapiske kasneje objaviš, jih prodajaš tukaj.

Naloži svoje gradivo

Učni načrt

Podatki so iz učnega načrta, ki ga objavlja Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko. Prebrano 6. 9. 2026. Poglej izvirnik

6 kreditnih točk

Obveznosti v urah

  • Predavanja25 ur
  • Vaje30 ur
  • Samostojno delo120 ur
  • Seminarji5 ur

Vsebina

  1. Regulacija genske ekspresije z vezavo trans delujočih proteinov na cis delujoče regulatorna zaporedja, modifikacija histonov in remodulacija strukture kromatina
  2. Alternativna transkripcija in procesiranje posameznih genov
  3. Alelno specifična ekspresija: metilacija, DNA vtisnjevanje (imprinting), polimorfizmi v regulatornih zaporedjih
  4. Uvod v transkriptomiko
  5. Sekvenciranje RNA s tehnologijo sekvenciranje naslednje genracije (NGS) (RNA-seq): priprava vzorca (knjižnic), sekvenciranje na aparatu, bioinformatska analiza podatkov RNA-seq
  6. Sekvenciranje RNA v posamezni celici (scRNAseq)
  7. Kemija vezave molekul na površino, priprava biočipov (vezava cDNA in oligo nukleotidnih sond)
  8. Statistična analiza ekspresijskih biočipov: načrtovanje eksperimenta, normalizacija, statistika primerjalne analize ekspresije dveh vzorcev, linearni modeli in njihova uporaba pri kompleksnih eksperimentih, kjer primerjamo gensko ekspresijo v dveh ali večih situacijah (npr. različni tretmaji celic), postopki za sestavljanje klastrov, validacija podatkov, funkcijsko vrednoteneje z uporabo podatkovnih zbirk Gene ontology in DNA sekvenc
  9. Proteinske mikromreže
  10. Uporaba mikromrež v diagnostiki, načrtovanju in razvoju novih zdravil

Ocenjevanje

Pisni izpit 60 %, Ustni izpit 40 %

Pogoji za vključitev

Poznavanje osnov molekularne biologije, biokemije, humane genetike in bioinformatike

Literatura

  • 1. Passos G.A.: Transcriptomics in Health and Disease.; Springer Cham, 2022
  • 2. Pevsner J. : Bioinformatics and functional genomics, 3RD EDITION, 2015, John Wiley https://genetics.elte.hu/oktatasi_anyag/archivum/bioinfo/Bioinformatika_2018-2019/book.pdf

Kako deluje

  1. Zapiske kupiš enkrat in ostanejo tvoji.
  2. V aplikaciji iz njih dobiš kartice, kvize in Mai, ki pozna gradivo.
  3. Ceno določi avtor. Prodajalec je Mislo AI, račun dobiš od nas.